Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms