Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stx2Q00262 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stx2Q00262 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms