Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn1bP97952 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scn1bP97952 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms