Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfdP97946 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfdP97946 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
VegfdP97946 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfdP97946 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms