Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brca2P97929 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brca2P97929 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brca2P97929 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brca2P97929 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brca2P97929 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brca2P97929 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brca2P97929 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brca2P97929 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brca2P97929 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brca2P97929 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brca2P97929 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brca2P97929 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brca2P97929 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brca2P97929 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brca2P97929 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brca2P97929 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brca2P97929 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brca2P97929 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brca2P97929 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brca2P97929 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Brca2P97929 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca2P97929 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca2P97929 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca2P97929 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca2P97929 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca2P97929 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca2P97929 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brca2P97929 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms