Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smyd1P97443 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smyd1P97443 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms