Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig3P97386 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig3P97386 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig3P97386 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms