Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1bP97358 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1bP97358 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1bP97358 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1bP97358 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1bP97358 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1bP97358 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1bP97358 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1bP97358 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1bP97358 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1bP97358 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1bP97358 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1bP97358 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1bP97358 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1bP97358 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Taf1bP97358 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Taf1bP97358 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Taf1bP97358 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms