Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmsP97355 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmsP97355 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SmsP97355 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmsP97355 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmsP97355 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmsP97355 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SmsP97355 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmsP97355 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmsP97355 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmsP97355 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SmsP97355 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmsP97355 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmsP97355 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmsP97355 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmsP97355 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmsP97355 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmsP97355 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmsP97355 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmsP97355 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmsP97355 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmsP97355 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmsP97355 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmsP97355 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SmsP97355 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SmsP97355 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SmsP97355 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SmsP97355 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SmsP97355 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SmsP97355 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SmsP97355 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SmsP97355 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SmsP97355 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SmsP97355 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmsP97355 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmsP97355 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmsP97355 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmsP97355 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmsP97355 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmsP97355 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmsP97355 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmsP97355 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmsP97355 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmsP97355 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmsP97355 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmsP97355 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmsP97355 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SmsP97355 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SmsP97355 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmsP97355 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmsP97355 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmsP97355 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmsP97355 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SmsP97355 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SmsP97355 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmsP97355 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmsP97355 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmsP97355 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmsP97355 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmsP97355 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmsP97355 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmsP97355 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmsP97355 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmsP97355 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SmsP97355 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmsP97355 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SmsP97355 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SmsP97355 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmsP97355 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmsP97355 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SmsP97355 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmsP97355 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SmsP97355 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmsP97355 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmsP97355 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmsP97355 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SmsP97355 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms