Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HpcaP84075 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HpcaP84075 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HpcaP84075 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HpcaP84075 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HpcaP84075 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HpcaP84075 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HpcaP84075 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpcaP84075 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpcaP84075 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpcaP84075 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HpcaP84075 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HpcaP84075 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpcaP84075 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HpcaP84075 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms