Protein–RNA interactions for Protein: P82349

Sgcb, Beta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcbP82349 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcbP82349 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcbP82349 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcbP82349 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcbP82349 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcbP82349 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcbP82349 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcbP82349 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcbP82349 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcbP82349 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcbP82349 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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