Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx1P81068 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx1P81068 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx1P81068 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx1P81068 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx1P81068 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx1P81068 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx1P81068 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx1P81068 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx1P81068 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx1P81068 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms