Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx2P80206 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Otx2P80206 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx2P80206 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Otx2P80206 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx2P80206 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx2P80206 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otx2P80206 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Otx2P80206 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms