Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shox2P70390 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shox2P70390 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shox2P70390 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shox2P70390 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Shox2P70390 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shox2P70390 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Shox2P70390 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms