Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad50P70388 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad50P70388 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rad50P70388 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Rad50P70388 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rad50P70388 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad50P70388 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad50P70388 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad50P70388 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad50P70388 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad50P70388 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms