Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Stra8P70278 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stra8P70278 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra8P70278 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Stra8P70278 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stra8P70278 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stra8P70278 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms