Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SbdsP70122 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SbdsP70122 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SbdsP70122 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SbdsP70122 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SbdsP70122 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SbdsP70122 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SbdsP70122 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SbdsP70122 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SbdsP70122 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms