Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UbdP63072 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UbdP63072 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UbdP63072 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UbdP63072 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UbdP63072 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UbdP63072 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UbdP63072 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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UbdP63072 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UbdP63072 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UbdP63072 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UbdP63072 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UbdP63072 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UbdP63072 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UbdP63072 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UbdP63072 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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UbdP63072 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UbdP63072 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UbdP63072 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UbdP63072 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UbdP63072 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UbdP63072 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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UbdP63072 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UbdP63072 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UbdP63072 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UbdP63072 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UbdP63072 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UbdP63072 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UbdP63072 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UbdP63072 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UbdP63072 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UbdP63072 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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UbdP63072 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UbdP63072 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UbdP63072 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UbdP63072 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UbdP63072 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UbdP63072 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UbdP63072 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UbdP63072 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UbdP63072 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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