Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr2lP62876 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms