Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps28P62858 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps28P62858 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rps28P62858 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rps28P62858 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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