Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rab3cP62823 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rab3cP62823 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rab3cP62823 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rab3cP62823 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rab3cP62823 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rab3cP62823 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rab3cP62823 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rab3cP62823 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rab3cP62823 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rab3cP62823 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rab3cP62823 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rab3cP62823 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rab3cP62823 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rab3cP62823 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rab3cP62823 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab3cP62823 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab3cP62823 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab3cP62823 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab3cP62823 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab3cP62823 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab3cP62823 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab3cP62823 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab3cP62823 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab3cP62823 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab3cP62823 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab3cP62823 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab3cP62823 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab3cP62823 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab3cP62823 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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