Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vsnl1P62761 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vsnl1P62761 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms