Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnnP61807 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnnP61807 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnnP61807 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnnP61807 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnnP61807 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnnP61807 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnnP61807 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnnP61807 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnnP61807 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnnP61807 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnnP61807 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnnP61807 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnnP61807 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnnP61807 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnnP61807 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnnP61807 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnnP61807 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnnP61807 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnnP61807 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnnP61807 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnnP61807 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnnP61807 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnnP61807 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnnP61807 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnnP61807 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnnP61807 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnnP61807 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SnnP61807 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnnP61807 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SnnP61807 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnnP61807 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnnP61807 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnnP61807 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnnP61807 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnnP61807 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnnP61807 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnnP61807 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnnP61807 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnnP61807 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnnP61807 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SnnP61807 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms