Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PlnP61014 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PlnP61014 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PlnP61014 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms