Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ppfia3P60469 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ppfia3P60469 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms