Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b6P59708 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b6P59708 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3b6P59708 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms