Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr3bP59470 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr3bP59470 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms