Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nphp4P59240 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nphp4P59240 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nphp4P59240 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms