Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp1P59054 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csrnp1P59054 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms