Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Paxbp1P58501 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms