Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf16P58334 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf16P58334 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf16P58334 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf16P58334 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf16P58334 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms