Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dpf3P58269 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dpf3P58269 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms