Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcbp4P57724 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcbp4P57724 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms