Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NcstnP57716 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NcstnP57716 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NcstnP57716 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms