Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lim2P56563 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lim2P56563 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lim2P56563 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lim2P56563 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lim2P56563 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lim2P56563 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lim2P56563 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms