Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cox7bP56393 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms