Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms