Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fdft1P53798 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fdft1P53798 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms