Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Polr1cP52432 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Polr1cP52432 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms