Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LumP51885 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LumP51885 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LumP51885 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LumP51885 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LumP51885 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LumP51885 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LumP51885 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LumP51885 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LumP51885 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LumP51885 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LumP51885 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LumP51885 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LumP51885 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LumP51885 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LumP51885 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LumP51885 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LumP51885 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LumP51885 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LumP51885 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LumP51885 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LumP51885 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LumP51885 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LumP51885 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LumP51885 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LumP51885 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LumP51885 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LumP51885 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LumP51885 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LumP51885 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LumP51885 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LumP51885 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LumP51885 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LumP51885 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LumP51885 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LumP51885 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LumP51885 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LumP51885 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LumP51885 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LumP51885 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LumP51885 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LumP51885 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LumP51885 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LumP51885 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LumP51885 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LumP51885 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LumP51885 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LumP51885 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LumP51885 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LumP51885 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LumP51885 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LumP51885 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LumP51885 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LumP51885 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LumP51885 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LumP51885 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LumP51885 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LumP51885 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LumP51885 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LumP51885 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LumP51885 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LumP51885 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LumP51885 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LumP51885 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LumP51885 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LumP51885 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LumP51885 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LumP51885 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LumP51885 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LumP51885 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LumP51885 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LumP51885 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LumP51885 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LumP51885 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LumP51885 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LumP51885 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms