Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc4P51655 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpc4P51655 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms