Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfP51642 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfP51642 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfP51642 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfP51642 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfP51642 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfP51642 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfP51642 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfP51642 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfP51642 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfP51642 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfP51642 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfP51642 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfP51642 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfP51642 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfP51642 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfP51642 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfP51642 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfP51642 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfP51642 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfP51642 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfP51642 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfP51642 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfP51642 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfP51642 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfP51642 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfP51642 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfP51642 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfP51642 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfP51642 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfP51642 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfP51642 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfP51642 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfP51642 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfP51642 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfP51642 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfP51642 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfP51642 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfP51642 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CntfP51642 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CntfP51642 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfP51642 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfP51642 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfP51642 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfP51642 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfP51642 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfP51642 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfP51642 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfP51642 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfP51642 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfP51642 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfP51642 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfP51642 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfP51642 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfP51642 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfP51642 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfP51642 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfP51642 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfP51642 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfP51642 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfP51642 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfP51642 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfP51642 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfP51642 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfP51642 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfP51642 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfP51642 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfP51642 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfP51642 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfP51642 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfP51642 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfP51642 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfP51642 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfP51642 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfP51642 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfP51642 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfP51642 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfP51642 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfP51642 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfP51642 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfP51642 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfP51642 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfP51642 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfP51642 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfP51642 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfP51642 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfP51642 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfP51642 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfP51642 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfP51642 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfP51642 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfP51642 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfP51642 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfP51642 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfP51642 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfP51642 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfP51642 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfP51642 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfP51642 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfP51642 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms