Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa6P50704 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa6P50704 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa6P50704 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa6P50704 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa6P50704 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa6P50704 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Defa6P50704 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa6P50704 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa6P50704 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa6P50704 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa6P50704 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa6P50704 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms