Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csrp3P50462 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms