Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SftpdP50404 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SftpdP50404 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SftpdP50404 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SftpdP50404 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SftpdP50404 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms