Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cav1P49817 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cav1P49817 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cav1P49817 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cav1P49817 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cav1P49817 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cav1P49817 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cav1P49817 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cav1P49817 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cav1P49817 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms