Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptx3P48759 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptx3P48759 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms