Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prox1P48437 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prox1P48437 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prox1P48437 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prox1P48437 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms