Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capza1P47753 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Capza1P47753 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Capza1P47753 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms