Protein–RNA interactions for Protein: P47746

Cnr1, Cannabinoid receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnr1P47746 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnr1P47746 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms